Nel 1891, i Carmelitani Scalzi del monastero di Czerna, vicino ad Krzeszowic, iniziarono a cercare un posto per una nuova fondazione. Il criterio più importante per la scelta della località era la presenza di un ginnasio in città. Nel 1892, la candidatura di Wadowice fu presentata a Roma e già il 1 agosto i primi monaci si stabilirono in città. Inizialmente affittarono la casa di un tipografo, Franciszek Foltyn, che si trovava presso la pensione sulla strada Zatorski (oggi ul. Wojska Polskiego). I Carmelitani acquistarono il terreno per la costruzione dei templi e degli edifici monastici sul cosiddetto “Górka” (Altura). Offriva una vista dell'intera città galiziana con la chiesa parrocchiale dominante, la caserma del 56° Reggimento di fanteria, l'ospedale militare, la sinagoga, il palazzo di giustizia di recente costruzione e il carcere adiacente. Nel 1898, fu consacrata e posata la pietra angolare. Il progetto architettonico fu realizzato da R. Jordan di Vienna, mentre i lavori in loco vennero diretti dall'ing. A. Kozłowski. Un anno dopo, il vescovo di Cracovia di allora Jan Kniaź Puzyna consacrò la chiesa del monastero. La sua visita alla città fu un grande evento per gli abitanti di Wadowice.
Uno degli iniziatori della costruzione del Carmelo di Wadowice fu padre Józef Rybka (1854-1919), associato al monastero di Czerna. Fu molto probabilmente per sua intercessione che Wadowice venne scelta come sede del nuovo monastero. Nel 1914, a Wadowice tenne un fervente discorso patriottico a diverse centinaia di membri della Società Ginnastica “Sokół”, che erano partiti per la Bochnia per unirsi alle Legioni polacche.
L’incarico di Priore del Carmelo di Wadowice fu assegnato a S. Rafał Kalinowski (1835-1907). Nato a Vilnius, laureato all'Accademia dell'Ingegneria Militare Nikolayev di San Pietroburgo. Solo al 42 anni entrò nell'Ordine dei Carmelitani Scalzi e ne divenne il successivo riformatore. Morì nel monastero di Wadowice all'età di 82 anni. Papa Giovanni Paolo II lo ha proclamato beato nel 1983, e quindi santo nel 1991.