Pendant la période galicienne, les Juifs faisaient partie de la communauté de Wadowice. La plupart d’entre eux étaient actifs dans le commerce et l’artisanat. En 1880, ils représentaient plus de 8 % de la population totale de la ville (404 personnes), et à la veille de la Seconde Guerre mondiale, ils représentaient environ 20 % (2 000).
En 1892, un cimetière juif a été créé à côté du cimetière militaire. Dès 1876, la communauté juive a entrepris des recherches pour la localiser, et des terrains ont été achetés juste derrière la nécropole des soldats. À la porte d’entrée du cimetière se trouvait la maison pré-inhumation « Beit Tahara » (maison de purification). En face se trouvait la maison du gardien. Les questions d’enterrement ont été traitées par la confrérie religieuse Chevra Kadisha de Wadowice.
Outre les habitants de Wadowice et des villages environnants, les soldats de confession juive qui servaient dans la garnison locale ou qui sont décédés dans les hôpitaux locaux ont également été enterrés dans le cimetière. Pendant les années de la Grande Guerre, 42 soldats, servant principalement dans les régiments autrichiens et dans les formations de la défense intérieure hongroise, y ont été inhumés, et entre 1919 et 1920, 11 hommes, principalement de l’armée bolchevique.
Le cimetière a survécu presque intact à l’occupation allemande. Après 1945, le cimetière a été restauré grâce à la communauté religieuse de Cracovie. Il est aujourd’hui administré par la communauté religieuse juive de Bielsko-Biała. Le dernier enterrement a eu lieu en 1990.
Parmi les personnes enterrées dans le cimetière juif de Wadowice, il convient de mentionner Baruch Thieberg (d. 1902) et Henryk Karol Taub (1898-1919). Baruch Thieberg était un insurgé du soulèvement de Janvier et le premier juif à s’installer à Wadowice, après avoir fui le royaume de Pologne. À la suite de cet événement, la ville a connu un afflux rapide de population juive. Henryk Karol Taub était le fils de Samuel Taub. Après l’indépendance de la Pologne, il rejoint le 12e régiment d’infanterie à Wadowice. En tant que chef de section, il participe à la guerre polono-tchécoslovaque pour la Silésie de Těšín et la Trans-Olza, où il fut mortellement blessé à la poitrine par un coup de baïonnette (1919). Il a été enterré dans le cimetière juif d’Orłowa (aujourd'hui République Tchèque) et, en 1939, sa dépouille a été transportée à Wadowice.